Pertenece al estilo barroco. Su historia se remonta a la época musulmana, ya que se asienta en el solar de una mezquita, que tras la reconquista se convierte en iglesia. El nuevo edificio se comenzó en 1736 bajo la dirección del arquitecto Fray Antonio de San José. El templo tiene planta de cruz latina, con capillas laterales y dos portadas. La fachada principal es una de las joyas del arte barroco, por la disposición diagonal de sus pilastras y el arqueamiento de la cornisa y las molduras. Ambas puertas están adornadas con capiteles y guirnaldas, coronadas por dos medallones en los que se representan la “Apoteosis de San Nicolás” y al Santo en estado místico. Ambos han sido atribuidos a Francisco Salzillo. Destaca la cúpula octogonal, la torre de planta cuadrada y en el interior su decoración en estuco, típica del barroco. Acoge la imagen del Santísimo Cristo del Amparo y la Dolorosa, atribuida a Salzillo.