Situé dans la cathédrale, on remarquera plusieurs espaces comme le trésor reliquaire, la salle capitulaire, la sacristie, le chœur et la chapelle principale. La chapelle du trésor expose l'ostensoir réalisé par Enrique de Arfe au XVI^e siècle. Dans la sacristie nous remarquons un apostolat et l'Expolio du Gréco, ainsi que des peintures de Goya, du Titien, de Raphaël, Van Dyck, Bellini et un Saint François d'Assise sculpté par Pedro de Mena. Dans la salle qui suit le vestiaire se trouve une autre excellente collection de peintures, avec des œuvres de Vélazquez et de Ribera. La salle capitulaire, quant à elle, contient des fresques de Jean de Bourgogne, et les portraits de tous les prélats de l'archidiocèse. La chapelle principale expose son extraordinaire retable, auquel participèrent Enrique Egas, Felipe Vigarny, Copin de Holanda et Jean de Bourgogne, entre autres. Enfin, le chœur recueille une large exposition de sculpteurs comme Berruguete, Vigarny et Rodrigo Alemán.