La province de Biscaye est desservie par l'un des meilleurs réseaux d'autoroutes et de voies rapides du pays, et Bilbao est l'un des centres névralgiques des communications entre le nord de la péninsule Ibérique et le reste de l'Espagne.

L'autoroute AP-8 permet de gagner Donostia/Saint-Sébastien et Irún, d'où il est possible de rejoindre Bordeaux et Paris ou de se diriger vers Toulouse et Montpellier. L'AP-68, qui descend ensuite dans la vallée de l'Èbre, rejoint Barcelone et l'AP-7, qui longe la côte méditerranéenne. L'AP-68 mène également directement à Burgos, pour gagner ensuite Madrid, Valladolid ou le Portugal.

La gare routière Termibus, située en plein centre de la capitale, est le point de départ de nombreuses compagnies qui assurent quotidiennement des trajets régionaux nationaux et internationaux.

L'aéroport international de Bilbao, situé à environ 12 kilomètres de la ville, est considéré comme le principal aéroport du nord de la péninsule ibérique. Il dessert les plus grandes villes du pays et les principales destinations européennes. L'aéroport est relié à la ville par la ligne A3247 d'autobus qui dessert la gare Termibus après des arrêts place Moyua, au 79 Gran Vía et au 11 Alameda Rekalde. Ses horaires sont de 06h15 à 00h00 dans le sens Bilbao, et de 05h20 à 22h00 dans le sens aéroport.

La gare maritime du port de Santurtzi est le point de départ de ferries à destination de Portsmouth, en Angleterre. Ce service est assuré deux fois par semaine dans les deux sens et vous permet d'embarquer votre véhicule. Le port est accessible en bus urbain depuis la place Jado, via la ligne C-1 de train de banlieue et par l'autoroute AP-8.

Enfin, la gare de Bilbao-Abando accueille des trains longue distance de la Renfe. Une liaison quotidienne est assurée avec Madrid et Barcelone, et des trains desservent directement des régions comme la Galice, la Castille-León, la Rioja et l'Aragon.