La province de Biscaye est desservie par l'un des meilleurs réseaux d'autoroutes et de voies rapides du pays, et Bilbao est l'un des centres névralgiques des communications entre le nord de la péninsule ibérique et le reste de l'Espagne.

L'autoroute A-8 conduit à Donostia/Saint-Sébastien et Irún, d'où on peut se rendre à Bordeaux et à Paris ou bien se diriger vers Toulouse et Montpellier. En empruntant l'A-68, qui descend ensuite le cours de l'Èbre, on peut se rendre à Barcelone et rejoindre l'A-7, qui longe la côte méditerranéenne. L'A-68 mène directement à Burgos puis, de là, à Madrid, à Valladolid et au Portugal.

La gare routière Termibus, située en plein centre de la capitale, est le point de départ de nombreuses compagnies qui assurent quotidiennement des trajets régionaux nationaux et internationaux.

L'aéroport international de Bilbao, situé à environ 12 kilomètres de la ville, est considéré comme le principal aéroport du nord de la péninsule ibérique. Il dessert les plus grandes villes du pays et les principales destinations européennes. L'aéroport est relié à la ville par la ligne 3247 d'autobus à destination de la gare Termibus après un arrêt place Moyua. Il fonctionne de 06h20 à 00h00 en direction de Bilbao et de 05h20 à 22h00 en direction de l'aéroport, avec une fréquence de passage de 20 minutes environ.

La gare maritime du port de Santurtzi est le point de départ de ferries à destination de Portsmouth, en Angleterre. Ce service est assuré deux fois par semaine dans les deux sens et vous permet d'embarquer votre véhicule. Le port est accessible en bus urbain depuis la place Jado, via la ligne C-1 de train de banlieue et par l'autoroute A-8.

Enfin, la gare de Bilbao-Abando accueille des trains longue distance de la Renfe. Une liaison quotidienne est assurée avec Madrid et Barcelone et il existe des trains à destination de la Galice, des Asturies, du Portugal, de la côte méditerranéenne et de l'Andalousie.