San Juan de Boí pertenece al conjunto de iglesias románicas de La Vall de Boí, declarado Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO en el año 2000.

Situada en uno de los pueblos más importantes de La Vall de Boí, es una iglesia de planta basilical, con tres naves que terminan en ábsides semicirculares, excepto el ábside central modificado. Las naves de la iglesia están separadas por arcos de medio punto apoyados en pilares. Los pilares tienen planta circular y rectangular. El campanario, adosado a la fachada sur tiene forma cuadrada y está modificado en el último piso. Las pinturas murales originarias fueron arrancadas entre 1919 y 1923; actualmente se han hecho copias de las mismas en el interior y en el exterior. Destacan entre las pinturas el repertorio del Bestiario, la Lapidación de San Esteban y la escena de los músicos y malabaristas.