Ziel der in diesem Museum angebotenen Aktivitäten ist es, ein umfassenderes Wissen zur Vielfalt der Natur zu vermitteln. Mit seinen über 6 Millionen Exponaten zeigt das Museum eine der wichtigsten Faunaausstellungen, nicht nur aus Spanien sondern auch aus anderen Mittelmeergebieten. Außerdem verfügt es über interessante permanente Ausstellungen, darunter die Geschichte der Erde und des Lebens, wo man spektakuläre Exemplare wie z. B. die Reproduktion eines Diplodokus sehen kann. Ebenfalls permanent sind der Steingarten, in dem im Freien fossilisierte Baumstämme und Felsen ausgestellt werden, der Bereich ”Mittelmeer, Natur und Zivilisation" mit der Ausstellung über Ökosysteme und Fauna im Mittelmeerraum sowie das ”Königliche Kabinett", in dem man mit Jahrhunderte alten geschichtlichen Sammlungen eine Reise durch die Zeit machen kann.