Das Museum beherbergt Werke von unter anderem Berruguete, Diego de Siloé, Carducho, Mateo Cerezo und Bronzino sowie eine Sammlung mit Wandteppichen von Cornelis Schut. Der barocke Hochaltar aus dem 18. Jahrhundert ist mit Gemälden des Künstlers Anton Raphael Mengs geschmückt. Ebenfalls zu erwähnen sind die interessanten Grabstätten aus dem 14. Jahrhundert sowie verschiedene Heiligenfiguren, wobei die Gestalt von Nuestra Señora del Manzano besonders sehenswert ist.